移動計画を立てる上で最も重要な判断材料となるのが、費用と時間のバランスです。仮に移動ルートが存在した場合のバス利用と、王道であるJR利用の差を検証してみましょう。
まず所要時間についてです。ハウステンボス長崎駅所要時間を比較すると、JRの快速列車を利用した場合は約1時間15分〜1時間30分で直通します。一方で、仮に一般道経由や乗り継ぎを伴うバスを利用した場合、道路の混雑状況にも左右され、2時間以上を要することも珍しくありません。特に休日の夕方や連休期間中、国道205号線や34号線周辺は慢性的な渋滞が発生しやすいため、ダイヤ通りの運行は困難を極めます。
次に運賃の面です。ハウステンボス長崎駅高速バス料金を気にされる声も多いですが、直行便が存在しない以上、乗り継ぎ運賃が重なり割高になります。一方のJR運賃は普通乗車券のみで大人片道1,500円（運賃改定等による微小変動あり）。特急券を買い足さなくても快速列車に乗車できるため、追加コストもかかりません。ハウステンボスから長崎駅電車バス比較において、時間・運賃・定時性の全項目で電車が圧倒的な優位に立っています。
