厚手の鍋（鋳物ホーロー鍋やステンレス多層鍋が理想的ですが、密閉性の高いフタ付きの深型鍋でも十分調理可能）を用意し、以下のステップで進めます。
ステップ1：具材のカットと鍋への敷き詰め
玉ねぎは皮をむき、繊維に沿って1cm幅のくし形、または太めのスライスにカットします。鍋底にまず玉ねぎの半量を敷き詰め、その上に一口大に切った豚バラ肉を重ならないように広げます。さらにその上から残りの玉ねぎを被せ、最後に木綿豆腐を手で大きめの塊に割りながら乗せます。この「サンドイッチ構造」にすることで、底の玉ねぎから出た水分蒸気が豚肉と豆腐を包み込み、焦げ付きを防ぎます。
ステップ2：極弱火でじっくり蒸し煮にする
塩ひとつまみを振りかけ、鍋にぴったりとフタをして極弱火にかけます。火が強すぎると水分が出る前に鍋底が焦げてしまうため、最初は「本当にとろ火で大丈夫か」と感じる程度の弱火を維持してください。15分〜20分ほど経つと、フタの隙間から蒸気が立ち上り、鍋底から玉ねぎと豆腐の水分がたっぷりと湧き出てきます。
ステップ3：白味噌の「2段階投入」と煮込み
玉ねぎが透き通り、水分が具材の半分ほどまで浸かったらフタを開け、木べらで底から優しく全体を混ぜ合わせます。ここで用意した白味噌の半量（約60g）とみりんを加え、全体に溶かし込みます。再びフタをして弱火のままさらに15分ほどコトコトと煮込み、玉ねぎがくったりと柔らかくなるまで火を通します。
ステップ4：仕上げの追い味噌
玉ねぎが完全にとろける寸前の状態になったら火を止め、残りの白味噌を溶き入れます。味噌を2回に分けて入れる「プロの裏技」により、煮込みによる奥深い旨味と、炊きたてのようなフレッシュな味噌の香りの双方がスープに宿ります。火を止めてから10分ほど鍋ごと休ませると、味が劇的に馴染みます。
