早朝発のLCC利用時や、悪天候によるダイヤ乱れ、あるいは深夜着便の際に絶大な威力を発揮するのが、国内線ターミナルビル4階にある「新千歳空港温泉」です。
新千歳温泉の営業時間と宿泊利用のシステムは非常に優れており、午前10:00〜翌朝9:00（23時間営業）体制をとっています。深夜1:00以降も滞在を続ける場合は別途深夜料金が加算される仕組みで、館内のリラックスルーム（リクライニングチェア完備）を利用して仮眠・宿泊が可能です。朝風呂や無料朝食サービスも提供されているため、新千歳空港での早朝・深夜の過ごし方として旅行者の定番ルートとなっています。
ただし、連休や観光ハイシーズン、大雪による欠航多発時には入場制限がかかることもあるため、宿泊を前提とする場合は空港直結の「エアターミナルホテル」や近隣JR千歳駅周辺のホテル予約も視野に入れておくのが賢明です。
