波乱万丈な人生を歩んできた清水健太郎ですが、その私生活における結婚歴も平坦なものではありませんでした。これまでに3度の結婚歴が確認されています。
1人目の妻は、1980年に結婚したアメリカ人モデルのアシュリー氏（後に離婚）。その後、一般女性との2度目の結婚と離婚を経て、2014年10月に現在の妻である清水瑞穂（しみず みずほ）さんと入籍しました。
瑞穂さんは元女優で、清水健太郎より18歳年下です。彼女は単なる配偶者にとどまらず、清水健太郎の個人芸能事務所である「株式会社オフィスKS」の代表取締役を務めています。過去に何度も過ちを犯し、社会的な信用を失いかけた彼を精神的・実務的に支え続け、現在も献身的なマネジメントを行っています。
夫妻の間に子供はいませんが、瑞穂氏の存在こそが、彼が再び過ちを繰り返すことなく安定した日常生活を維持できている最大の防波堤となっています。
