久能山東照宮は、ただ階段を登って参拝するだけではその真価の半分も味わえません。境内には江戸幕府屈指の技術と政治的企図が込められた意匠が随所に散りばめられています。
最大の見どころは、平成22年（2010年）に国宝に指定された社殿群（本殿・石の間・拝殿）です。徳川2代将軍秀忠の命により、名工・中井大和守正清がわずか1年7ヶ月という驚異的な短期間で完成させました。本殿と拝殿を「石の間」で繋ぐ「権現造（ごんげんづくり）」の完成形と称され、黒漆塗りをベースに極彩色の彫刻や金箔が贅沢に施されています。
ここで見逃してはならないのが、社殿の彫刻に込められた「平和へのメッセージ」です。拝殿の欄間には、中国の故事に由来する「司馬温公の瓶割り（生命尊重の教え）」や、瓢箪から駒が出る様子、さらには前脚を折って休む馬（蟇股の目貫きの馬）が彫られています。これは「戦乱が終わり、軍馬が戦場に出る必要がなくなった平和な時代」を象徴しており、戦国を終わらせた家康の治世理念が色濃く反映されています。
また、社殿の床下や軒回りを凝視すると、葵の御紋が一つだけ上下逆さまに取り付けられた「逆さ葵（さかさあおい）」の彫刻を見つけることができます。「建物は完成した瞬間から崩壊が始まる」という古来の思想に基づき、あえて一箇所だけ未完成のまま残すことで、徳川の永続と魔除けを祈願した職人たちの粋な知恵です。
境内奥の「神廟（しんびょう）」は、家康の遺骸が埋葬された真の聖域であり、強力なパワースポット（出世運・勝負運・延命長寿のご利益）として信仰を集めています。神廟の宝塔は高さ5.5メートルあり、家康の遺言によって西（京都・大坂方面）を向いて建てられています。
社殿から下った場所に位置する「久能山東照宮博物館」も見過ごせません。徳川歴代将軍の甲冑や武具、日用品など2,000点を超える貴重な文化財を収蔵しています。中でも全国の歴史ファンや刀剣愛好家から絶大な評判を誇るのが、家康の愛刀として知られる重要文化財の太刀「ソハヤノツルキ（ウツスナリ）」です。三方ヶ原の戦いや関ヶ原の戦いを経て家康の手元に渡り、死に臨んで「この刀の切先を西国に向けて置け」と命じられた名刀であり、その研ぎ澄まされた刃文と歴史的オーラは圧巻の一言に尽きます。
さらに、参拝の証として授与される御朱印の種類も豊富です。通常の御朱印に加え、国宝指定記念の限定御朱印、徳川家の家紋があしらわれた金泥の限定墨書、四季折々の催事に合わせた特別和紙の御朱印など複数展開されており、御朱印巡りの愛好家からも高い評価を得ています。
