開催期間中、みなとみらいの国際大通り周辺や臨港パーク隣接道路では、車両通行止めを含む大規模な交通規制が敷かれます。パシフィコ横浜の地下駐車場をはじめとする周辺パーキングは午前中から満車となり、入出庫に数時間単位のタイムロスが発生するため、車での来場は避けて電車・バスなどの公共交通機関を利用するのが鉄則です。
また、気になる天候の影響について、開港祭は基本的に雨天決行・荒天中止の方針で運営されます。ただし、花火やドローンショーに関しては、強風や落雷注意報の発令など安全確保が難しい場合、プログラムの一部変更や打ち上げ中止となるケースがあります。当日の天候が不安定な場合は、横浜開港祭実行委員会の公式SNSや公式サイトで発表される最新の開催判断をリアルタイムで確認しましょう。