智恩寺は、山形県の亀岡文殊、奈良県の安倍文殊院（または桜井の安倍文殊）と並び、「日本三文殊」の一つに数えられる臨済宗妙心寺派の古刹です。地元では古くから「切戸（きれど）の文殊」あるいは「九世戸（くせど）の文殊」の通称で親しまれてきました。
寺伝によると、その歴史の始まりは平安時代初期の大同3年（808年）、平城天皇の勅願によって建立されたことに遡ります。この地には古来、海を荒らす悪龍が住み着いていましたが、中国・五台山から文殊菩薩をお迎えして説法を行ったところ、龍が改心して仏教の守護神になったという伝説が残されています。
本尊の「文殊菩薩騎獅像」は秘仏とされており、知恵を司る菩薩として名高い存在です。本堂である文殊堂の堂々たる佇まいは、中世から近世にかけて丹後地域における信仰の中心地であった威厳を今に伝えています。
