本編のラスボスを撃破した後も、リメイク版ならではの真の挑戦が待っています。聖剣伝説3の裏ボスであるアニスの攻略は、本編クリア後に追加される新エピソードを進め、各キャラクターがクラス4へと到達した段階で解禁されます。
アニス戦は複数形態に分かれており、第1形態の魔女姿では広範囲の魔法攻撃、第2形態のドラゴン姿ではフィールド全体を覆う破滅技を連発してきます。攻略の秘訣は、詠唱開始と同時にフィールドに出現するクリスタルを物理攻撃で迅速に破壊し、大技を不発に終わらせることです。アニスの弱点属性は形態ごとに目まぐるしく変化するため、無属性の物理特化ビルドを組むか、全体セイバー系アイテムを臨機応変に切り替える戦術が最も効果的です。
さらに、シリーズ伝統の最強隠しボスとして恐れられる聖剣伝説3のブラックラビの倒し方についても触れておかなければなりません。デュラン・アンジェラ編のラストダンジョン「ガラスの砂漠」の隠し通路に潜むこの凶敵は、裏ボスを凌駕する超高火力と即死級魔法、高頻度の仲間召喚を繰り出してきます。
ブラックラビ戦では、光属性の吸収特性に注意し、闇属性または無属性の攻撃を徹底することが鉄則です。即死無効やモグ化・チビ化を防ぐ耐性リングを全員に装備させ、操作キャラクターは敵の周囲を旋回しながら隙を見て大技を叩き込むヒット＆アウェイを徹底します。
これらの激闘を制した後は、聖剣伝説3のクリア後引き継ぎとやり込みを存分に堪能できます。強くてニューゲームでは、取得したアビリティや所持金、サボテン君の発見状況を完全に引き継いだ状態で周回プレイが可能です。さらにアップデートで追加された最高難易度「ノーフューチャー」では、被ダメージの大幅増加や制限時間付きボス戦など、極限の緊張感の中で構築の完成度を試すことができます。
