オタク.comを語る上で避けて通れないのが、数々の凄惨なトラブルです。ネット上で今なお語り継がれるオタクcom炎上の真相を紐解くと、PVを稼ぐためならクリエイターの尊厳や事実関係すら平然と踏みにじる、過激なアテンション・エコノミーの暗部が浮き彫りになります。
とりわけ問題視されたのは、アニメ制作会社や声優、漫画家に対する悪質なネガティブキャンペーンでした。作品の些細な作画乱れを過剰に叩き立て、コメント欄の対立煽りを自作自演で加速させる手口は、関係各所から強い反発を買いました。過去には、ある制作関係者がSNSで「身に覚えのないデマを拡散され、スタッフが精神的に追い詰められた」と悲痛な手記を公開し、名指しで批判を展開した事件も記録されています。
では、このサイトを裏で操っていたオタクcom運営者の正体は誰だったのでしょうか。ネット上では「大手IT企業の仕掛け人が関与している」「特定の組織的グループが複数のまとめサイトを一括管理している」といった憶測が長年囁かれてきました。
サイバーセキュリティ専門家およびWHOIS情報の追跡調査によると、実態は国内法人を隠れ蓑にしたアフィリエイト専業グループ、あるいは個人アフィリエイターのネットワークであった可能性が極めて濃厚です。収益受取口座の凍結や大手広告代理店によるアドフラウド（不正広告）対策の厳格化に伴い、表舞台に一切名乗り出ることなく、広告収入の途絶とともにサイトを放棄したと見られています。
