横浜ベイクォーターが関東圏の愛犬家から絶大な支持を集めている背景には、徹底したペットフレンドリー設計があります。一般的に商業施設ではペットの同伴エリアが極端に制限されるケースが多い中、ここでは館内の共用通路（デッキ部分）をリード着用で愛犬と一緒に歩くことが可能です。
館内には犬連れ・ペット可のカフェやレストランが多数展開しており、テラス席を中心に愛犬と同席で食事が楽しめます。さらにドッグフード専門店やペットグッズショップ、トリミングサロンも充実しており、愛犬のトータルケアをワンストップで完結できる点が大きな強みです。
施設を快適に利用するためには、公式マナーの遵守が前提となります。館内エレベーターの一部（ペット同伴可能表示のある号機）を利用することや、屋内店舗への入店時はキャリーバッグやペットカートを使用するなど、一般の買い物客との共存を図るための配慮が徹底されています。
