本作の中核システム「ロジックチェス」は、証言を拒絶する相手の心理的装甲を思考の駒で崩していく知略バトルです。持ち時間がリアルタイムで減少していくため、焦りから選択ミスを犯しやすい設計になっています。鉄則は「相手が警戒している時は様子を見る（沈黙する）」「相手が感情的になった、あるいは矛盾を漏らした瞬間に踏み込む」というリズムの把握です。
各エピソードの核心的な難所と、進行に必要な正しい手順の要点は以下の通りです。
第1話「逆転の標的」〜第2話「獄中の逆転」
第1話では大統領暗殺未遂という国家規模の事件から幕を開けます。ロジックチェス初登場となる田中太郎戦はチュートリアル的位置付けですが、第2話の刑務所捜査からは本格化します。刑務所長・美和マリーや囚人・折中秀治とのチェス戦では、相手の表情の動揺を捉える観察眼が求められます。特に折中戦では「チェス盤の配置」に惑わされず、「ボクシンググローブの傷」や「刑務所内の規則」といった物理的矛盾を突く選択肢を順序通り選ぶ必要があります。
第3話「受け継がれし逆転」：過去と現在が交差する因縁の調理場
御剣怜侍の亡き父・御剣信を操作する過去パート（IS-7号事件）と、現代の怜侍パートが二重構造で進行する屈指の名エピソードです。ここでつまずきやすいのが、鑑識官・緒屋敷司とのロジックチェスと、お菓子のデザインに関する証拠品のつきつけです。「天海一誠が作ったデザートの写真」と「現場に残されたレシピ」の差分を綿密に比較し、見取り図と死因の食い違いを論理的に繋ぐ必要があります。信楽盾之の若き日の言動にも、現代パートの突破口となるヒントが隠されています。
第4話「忘却の逆転」：孤立無援の法廷と美雲の記憶喪失
記憶を失い、殺人容疑をかけられた一条美雲を救うため、御剣が検事バッジを返上して挑む緊迫の章。検事審査会（P.I.C.）会長・一柳萬才の強大な政治的圧力のもと、水鏡秤裁判官との熾烈なロジックチェスが展開されます。ここでは「感情に訴えかける選択肢」はすべてトラップであり、淡々と「美雲が持っていた手帳」「現場の防犯カメラの死角」「屋上への侵入経路」という客観的事実を突きつける選択肢を選び続けなければ、持ち時間は一瞬で尽き果てます。
第5話「大いなる逆転」：絡み合うすべての伏線と最終決戦
映画撮影所、孤児院、大統領暗殺、IS-7号事件、SS-5号事件のすべてが1点に収束する超長編エピソードです。怪獣「ボルモス」の着ぐるみ、花火の打ち上げ時間、遺留品のトラックの荷台など、これまで手に入れた膨大な情報が総動員されます。終盤のロジックチェスおよび証拠品つきつけでは、一切の妥協が許されません。相手が論点をすり替えるたびに「つきつける：現場写真」や「つきつける：相関図」で外堀を埋めていく論理の緻密さが求められます。
