作中で最も愛され、同時に最も神秘的な存在がナカタさんです。彼の正体は、カフカ少年の「無意識の影（シャドウ）」であり、魂の欠損を埋める依代（よりしろ）として機能しています。ナカタさんは自らを「中身が空っぽの器」と称しますが、その空虚さゆえに、世界を調整する特異な力を宿していました。
ナカタさんに課せられた最大の使命は、異界と現世を繋ぐ「入口の石」を開き、そして再び閉じることでした。入口の石とは、現実の論理と無意識・死者の世界を隔てる境界のメタファーです。東京で父の呪念（ジョニー・ウォーカー）を物理的に絶ったナカタさんは、青年の星野くんと共に高松へ渡り、石を開くことでカフカ少年が異界の森へアクセスできる通路を確保しました。
任務を全うしたナカタさんは静かに息を引き取り、その亡骸からは正体不明の不気味な「白いモノ」が這い出します。星野くんがそれを退治し、再び入口の石を閉じたことで、狂いかけていた世界のバランスは正常へと戻されました。ナカタさんは、カフカ少年が背負うはずだった原罪と宿命を肩代わりし、彼を再生へと導く救済者だったと考えられます。
