平面のドット絵に満足したクラフトファンから絶大な支持を集めているのが、立体的なアイロンビーズ作品の組み立てです。
最もわかりやすい立体構造は、「はめ込み式（インターロック）」の技法です。例えば「緑の土管」を作る場合、丸型や四角型のパーツを円筒状に積み重ねるか、十字型にスリット（凸凹の噛み合わせ）を設けたパーツを直角に交差させることで、接着剤を使わずに自立する立体オブジェが完成します。
立体マリオを制作する際は、体の各パーツ（頭・胴体・両腕・両脚）を平面的に少しずつ厚みを変えて何層か作り、熱で溶かしたビーズ同士をピンポイントで圧着するか、クラフト用ボンドやグルーガンで積層接着します。飛び跳ねるアクションポーズを土管の上に固定すれば、まるでゲーム画面から飛び出してきたかのようなジオラマが完成します。
