戦闘システムは、伊織自身が操る「五つの型（地・水・風・火・空）」の切り替えと、セイバーへの共鳴指示、そして一時的にサーヴァントを直接操作する交代アクションが融合したハイブリッドな仕様です。
大型の怪異や敵サーヴァントには「外殻ゲージ」と呼ばれる強固な防御障壁が存在し、通常攻撃だけでは怯みません。プレイヤーは敵の大技に「秘剣」や「魔術」を合わせるカウンター、相手の攻撃をジャスト回避して背後を取る「応刀」、そしてセイバーとの連携技「共鳴絶技」を適切なタイミングで叩き込む戦術的判断を求められます。
難易度設定は「剣客（ノーマル）」「剣豪（ハード）」に加え、アクションが苦手な人向けの「剣士（イージー）」が用意されています。アイテム使用による即時回復や属性付与の砥石システムが充実しているため、アクション初心者であっても工夫次第で十分に突破可能です。一方で、高難易度では敵の攻撃力が跳ね上がり、手に汗握る真剣勝負の緊張感を存分に味わうことができます。
