騒動を収束させるべく、ペルーや国際的な法医学研究所、大学の独立した研究者たちが本格的な鑑定に乗り出しました。実施された宇宙人ミイラのCTスキャン解析は、遺体の構造に関する決定的な矛盾を浮き彫りにしています。
X線およびCT画像によると、小型ミイラの骨格配置は生物学的に機能し得ない構造でした。首の骨には鳥類の骨、大腿部には哺乳類の骨格が逆向きやつなぎ合わせで配置され、関節同士が接続されていない不自然な箇所が多数見つかりました。関節軟骨や筋組織の痕跡もなく、生き物として活動していた骨格構造では到底なかったのです。
さらに注目された宇宙人ミイラのDNA鑑定結果ですが、マウサン氏側が「30％以上が未知のDNA」と主張したデータの実態は、極度に劣化した古代人骨のDNAに、土壌菌や現代の豆・植物の遺伝子がコンタミネーション（混入）した結果であることが判明。地球外由来の遺伝子配列などどこにもなく、既知の生物素材の寄せ集めに過ぎないことが科学的に証明されました。
