一人旅の女性から特に多く寄せられる懸念が、「夜行バスで隣に見知らぬ異性が座るのではないか」という心理的不安です。この点に関して、ネット上には一部古い情報や誤解が存在します。
ジャムジャムライナーでは、女性が単身でも安心して乗車できるよう、「女性安心シート」および「女性専用エリア便」の運用を精力的に推進しています。「女性安心」と記載された便では、4列シートであっても自動配席システムにより「通路を挟まない隣り合う座席には必ず同性（女性同士）が配置される」アルゴリズムが組まれています。男性の隣に女性が配置されることは運用規程上排除されているため、過度な心配は無用です。
さらに、女性専用フロアや女性専用車両として設定されている便を選べば、乗客全員が女性となるため、深夜の車内でも周囲に気兼ねなくメイク落としやリラックスウェアへの着替えが可能です。ただし、ここで注意すべき盲点があります。同伴者であっても異性の家族やパートナーと一緒に予約した場合、システムが女性エリアから除外して一般席へ誘導することがあります。複数人で乗車する際は、座席配列のプレビュー画面を念入りに確かめる作業を怠ってはなりません。
