充実した学習環境を背景に、幕張総合高校の進学実績は毎年堅調な結果を残しています。国公立大学では、地元である千葉大学をはじめ、筑波大学、横浜国立大学、東京都立大学などに現役合格者を輩出しています。
私立大学への進学実績においては、早稲田大学・慶應義塾大学・上智大学・東京理科大学などの最難関グループへの合格実績を保持しつつ、GMARCH(学習院・明治・青山学院・立教・中央・法政)へ毎年数百名規模の合格を出しています。また、単位制ならではのきめ細かな評定取得により、難関私立大学の指定校推薦枠を狙いやすい点も大きな魅力です。