大森学園高等学校の教育体系は、大きく「普通科」と「総合技術科」の2学科で構成されており、生徒一人ひとりの学力と将来の進路希望に合わせた4つのコース設計がなされています。各コースの偏差値レンジと学習特徴は明確に差別化されています。
普通科には最難関の「国立・特進コース（偏差値56〜58）」、中堅・上位私大を目指す「選抜コース（偏差値50〜52）」、多様な進路に対応する「総進コース（偏差値46〜48）」が設置されています。特進コースでは放課後講習や長期休業中の特別講座がカリキュラムに組み込まれ、国公立大学や早慶上理、GMARCH（学習院・明治・青山学院・立教・中央・法政）を視野に入れた指導が行われています。選抜コースは部活動と両立しながら日東駒専（日本・東洋・駒澤・専修）以上の合格を目指す生徒に人気です。
一方、伝統を受け継ぐ「総合技術科（偏差値43〜45）」は、機械、電気、情報、自動車などの工業・テクノロジー分野を実践的に学ぶ学科です。1年次に基礎を幅広く学び、2年次から各専門分野へと分かれるカリキュラムにより、ミスマッチを防ぐ工夫が施されています。
入試形態においては、推薦入試（単願）と一般入試（併願優遇）が中心となります。東京都および神奈川県の公立高校併願校として選ばれるケースが多く、内申点（調査書の評定）が基準となります。3科（国・数・英）または5科、9科の基準が各コースごとに細かく設定されており、英検3級・準2級以上、数検・漢検、3年間皆勤、生徒会活動、部活動の実績などによる内申加点制度も用意されています。基準値ギリギリの受験生であっても、資格取得や日頃の学校生活の実績を適切にアピールすることで併願優遇を確保できる仕組みが整っています。
