目白研心高校の独自性を際立たせているのが、英語教育に特化したSEC（Super English Course）の存在です。単に受験英語の文法問題を解くためのクラスではなく、「英語を道具として自らの意見を発信する力」の育成に重きを置いています。
外国人ネイティブ教員が担任または副担任としてクラス運営に関わり、ホームルームから日常の対話まで英語が飛び交う環境を整備。高校2年次には全員参加となる長期・短期の海外留学プログラムがカリキュラムに組み込まれており、カナダやオーストラリアなどの提携校で現地生活を体験します。留学期間中の取得単位が同校の卒業単位として認定されるため、3年間で高校を卒業できる点もSECが選ばれる理由です。
卒業生の手記や保護者懇談会での声からは、「SECのプレゼンテーション演習やディベートの授業を通じて、人前で堂々と自己表現する度胸がついた」「海外大学への直接進学や、上智大学、国際基督教大学（ICU）、立教大学異文化コミュニケーション学部などの総合型選抜（旧AO入試）で強力な武器になった」という実感が語られています。高い語学意欲を持つ生徒が集まるため、クラス内の知的刺激と学習モチベーションが極めて高いコミュニティを形成しています。
