日が落ち、周囲が深い闇に包まれると、境内は昼間とはまったく異なる表情を見せる。季節ごとに実施される夜間特別拝観では、最新の超高演色LEDを用いたライトアップが施され、阿字池の静かな水面に黄金色に輝く堂宇が見事な逆さ富士ならぬ「逆さ鳳凰堂」となって映し出される。その光景は息をのむほど美しい。
光の角度や強さは、周囲の自然生態系や木造建築への影響を最小限に抑えるよう緻密に設計されている。過度な装飾を排し、建築本来の木肌の温もりや朱色のグラデーションを引き立てる照明演出は、訪れた人々に強い感銘を与える。漆黒の夜空に浮かび上がる屋根の上の金色の鳳凰は、まるで今にも羽ばたき始めるかのようだ。
