薬学部（6年制）在学の究極の目標は薬剤師国家試験の合格だ。この試験、全国平均の新卒合格率は例年79〜83%前後で推移しており（厚生労働省発表データより）、大学ごとに合格率に大きな開きがある。
日本薬科大学の合格率については、年度によって変動があり、固定的な優位を誇るとはいえない年もある。受験生・保護者が陥りがちな落とし穴は、「大学公式サイトに掲載された合格率」を単純に信じることだ。大学公式の「合格率」には、受験を回避した学生（卒業延期・留年・そもそも卒業試験で落とした層）を母数から除外した「受験者ベース」の数値が使われることがある。より実態に近いのは「入学者全体に対する合格者数」、すなわち「出願者数または入学者数ベースの合格率」で比較することだ。
国家試験対策の学内体制という点では、6年次において補講・模擬試験・個別指導などの対策プログラムが整備されている。在学生の声から見えるのは、「3〜4年次の進級試験が相当厳しく、ここで脱落者が出る」「6年次の国試対策は大学主導でしっかり組まれており、やり切れた人は合格している」という流れだ。要するに、6年間を通じた継続的な学習の積み上げなしに合格は見えてこない構造になっており、入試難易度の低さが「楽に国家試験を取れる」を意味しないことは強調しておきたい。
