原作漫画が再始動した当時、ファンが最も熱望していたのが「アニメ『けいおん!』第3期」の制作でした。しかし、現在に至るまで3期が制作されることはありませんでした。その最大の理由は、京都アニメーションが手掛けたアニメ版が『映画 けいおん!』をもって芸術的に完全完結していたからに他なりません。
アニメ第2期『けいおん!!』の最終回、そして劇場版では、卒業を迎える唯たちが後輩の梓へ贈った名曲『天使にふれたよ!』をクライマックスに据え、青春の終わりと旅立ちをこの上ない完成度で描き切りました。監督の山田尚子氏をはじめとする制作陣は、高校3年間の限られた輝きをフィルムに焼き付けることに全力を注いでおり、商業的な都合だけで蛇足となる続編を作る意図はありませんでした。
加えて、アニメ1クールを制作するために必要な原作ストックが、『college』『highschool』ともに各1巻ずつしかなかったという物理的な分量不足も決定的な要因です。舞台が大学と高校で完全に2つに分断された原作を無理にアニメ化すれば、本編が持っていた密度の高い人間ドラマを再現することが極めて困難だったという制作上の判断があったと見られています。