中央区立総合スポーツセンターの最大の強みは、中央区日本橋という一等地にありながら、民間ジムの月会費相場(月額1万〜1万5,000円程度)を大幅に下回る圧倒的なコストパフォーマンスにあります。券売機で都度利用券を購入するシステムとなっており、入会金や月額固定費の縛りなく、自分のペースで運動習慣を維持できます。
多くの自治体では区外利用者に2倍前後の割増料金を設定するケースが見られますが、当センターの個人利用(プール、トレーニングジム、卓球、ジョギングコースなど)に関しては、区内・区外を問わず同一の利用料金が適用されています。近隣の千代田区、江東区、墨田区などの在住者や、人形町・茅場町・水天宮前エリアに勤務するオフィスワーカーが日常的に利用しやすい設計となっています。
区外利用者が注意すべき最大の差異は、「団体貸切予約」や「一部の区民限定優先プログラム」における抽選優先度です。個人利用の入場に関しては区別なく受け入れていますが、競技場全体の貸切予約や特定の区民向け定期講座では、中央区在住・在勤・在学者の登録カードが優先されます。