大鳥大社では、御朱印を収めるためのオリジナル御朱印帳も極めて完成度が高く、複数種が常時・または季節限定で用意されています。神社ファンや参拝記録のデータベースによると、初穂料は2,000円〜3,500円（御朱印代込み、または帳面のみ）の価格帯で展開されています。
代表的な御朱印帳のバリエーションは以下の2系統に大別されます：
- 黒地鳳凰紋御朱印帳（定番モデル・初穂料約2,000円）： 漆黒の布地に、天へと力強く飛翔する金銀の鳳凰と霊雲がシンプルかつ重厚に織り込まれたロングセラー。シックで引き締まった美しさを持ち、男性・女性を問わず幅広い層に選ばれています。和泉国一宮巡礼の1冊目としても最適です。
- 「千種の杜」季節限定御朱印帳（特別豪華モデル・初穂料約2,500円〜3,500円）： 神域である千種の杜をモチーフに、春・夏・秋・冬の四季折々の草花が金襴織物（きんらんおりもの）で絢爛豪華に織り上げられたモデル。季節ごとに表紙デザインの色調が変化し、触れるだけで上質さが伝わる凹凸感のある織りが施されています。
いずれの御朱印帳も蛇腹（じゃばら）折り仕様となっており、墨の裏写りを防ぐ高品質な奉書紙（ほうしょし）が採用されています。大鳥大社を起点に堺周辺の古社や泉州の式内社を巡る予定があるなら、最初の参拝時にこちらのオリジナル御朱印帳を頒布してもらい、1頁目に直書きの御朱印をいただくのが最高の参拝ルートです。
