庄小学校の教育環境を語る上で欠かせないのが、進学先である倉敷市立庄中学校との連携体制です。多くの公立中学校が2〜3つの小学校から生徒を集める「合流型」であるのに対し、庄中学校は基本的に庄小学校の卒業生がそのまま進学する「1対1」の学区構成となっています。
この構造には、児童・生徒にとって大きなメリットがあります。小学校6年間の友人関係や生活リズムを土台にしながら中学校生活をスタートできるため、進学に伴う心理的負担（いわゆる「中1ギャップ」）が大幅に軽減されます。教員間でも小学校での学習履歴や指導上の留意点が細やかに引き継がれるため、9年間を見通した一貫性のある生徒指導が行われています。
部活動や生徒会活動を通じた小中交流も定期的に行われており、小学生が高学年の段階から中学校生活のイメージを具体的に持てる環境が整っています。高校受験に向けた基礎学力の定着においても、地域密着型の学習塾が中庄駅周辺に多数展開しており、学校外の学習支援体制も盤石です。
