インターネット上の掲示板やSNSを精査すると、「生徒間のカーストがある」「意見のぶつかり合いから孤立した」といった書き込みが散見されます。宝仙学園中学校の掲示板における噂の真相を追究すると、そこには同校特有の学習スタイルと生徒指導の力学が関係していることが分かります。
宝仙学園中学校共学部の象徴である「理数インター」では、少人数グループでの協働学習やプレゼンテーション、ディスカッションが日常的に行われます。互いに意見をぶつけ合い、論理的に課題を解決するスキルを磨く環境である反面、自己主張の強い生徒と控えめな生徒の間で意見の衝突が起こりやすい側面を持ちます。取材や口コミ検証によると、陰湿な暴力や集団無視といった組織的ないじめというよりは、グループワーク内の主導権争いや価値観の相違から生じるトラブルがネット上で誇張されて拡散されたケースが目立ちます。
教育現場の報告によると、学校側は小さな兆候を見逃さないよう「いじめ防止対策委員会」を中心に早期介入を行う体制を敷いており、噂されるような「いじめの放置・隠蔽」を示す確証は確認されていません。