特別公開の最大の魅力は、普段は双眼鏡越しでも見られないような至近距離で本物の美術品と空間を体感できる点にあります。見どころは大きく3つのカテゴリーに分類されます。
1. 秘仏開帳（平安〜鎌倉期の仏教彫刻）
普段は固く閉じられた厨子の扉が開かれ、本尊の慈悲深い表情を拝むことができます。平安初期の一木造による量感あふれる如来像や、鎌倉時代の慶派仏師が手掛けた玉眼入りの躍動感ある明王像など、堂内のほの暗い蝋燭や間接照明の中に浮かび上がる仏の姿は、美術館のガラスケース展示では決して味わえない崇高な臨場感を放ちます。
2. 近世障壁画と方丈空間の調和
狩野探幽、長谷川等伯、海北友松といった巨匠たちが手掛けた襖絵が、建築空間（方丈や書院）と一体となった本来の配置で公開されます。床から差し込む自然光の角度によって金箔の反射が刻一刻と変化する様は、当時の絵師たちが計算し尽くした空間芸術の極致です。
3. 寺宝展と名勝庭園の特別開放
通常は立ち入りが制限されている庭園の奥深くや茶室、門跡寺院に伝来する歴代天皇の消息（手紙）や密教法具など、歴史の転換点を物語る一次史料が一堂に会します。各会場には京都古文化保存協会が育成した学生ガイドや専門解説員が常駐しており、背景知識がない初学者でもその価値を深く理解できるよう配慮されています。
