受験難易度の観点において、東京農工大学工学部偏差値は国公立大学工学系の中でも上位に位置付けられます。河合塾のボーダーラインでは学科により55.0〜62.5（共通テスト得点率約70〜78%）を推移しており、難関私立大の理科大やMARCH理工学部の上位併願先・本命先として確固たる地位を築いています。
工学部は生命工学科、生体医用システム工学科、応用化学科、化学物理工学科、機械システム工学科、知能情報システム学科などで構成され、近年ではデータサイエンスやAI、脱炭素技術を融合した教育プログラムが強化されています。特筆すべきは東京農工大学研究室評判の高さです。1研究室あたりの学部生配属人数が数名程度と非常に少なく、教授や准教授からマンツーマンに近い距離感で直接指導を受けられる環境は、メガ国公立大や大規模私立大学にはない大きなアドバンテージです。
