厚木リトルシニアを選ぶ保護者・選手が最も重視する指標の一つが、卒団後の進路実績です。厚木リトルシニアの指導方針は、「中学時代の勝利至上主義」だけに偏ることなく、「次のステージである高校野球で即戦力として活躍できる個の育成」に重点を置いています。
進路先には、神奈川県内の名門私立高校（東海大相模、桐蔭学園、横浜高校、慶應義塾、向上、平塚学園、武相など）をはじめ、公立の強豪校、さらには山梨、静岡、東北、関西など全国各地の甲子園常連校が名を連ねています。
監督・指導陣は選手の体格やプレースタイル、学業成績を綿密に見極め、本人の希望と高校側のニーズをすり合わせながら丁寧な進路相談を行います。過去には厚木リトルシニアの出身選手がドラフト指名を受けてプロ野球の世界へ羽ばたいた実績もあり、プロや大学・社会人野球で活躍するOBの存在が後輩たちの大きな道標となっています。
