「男池の水は生で飲めるのか？」という疑問に対して、地元の管理組合および由布市の観光公式データによると、水質検査基準を満たした極めて良質な天然水として知られています。現地では多くの来訪者がマイボトルや持参したコップで喉を潤しており、口に含んだ瞬間に広がるほのかな甘みと雑味のなさは、まさに名水百選の真骨頂です。ただし、免疫力の弱い乳幼児や高齢者の飲用、長期保存を前提とする場合は、念のため一度煮沸することが推奨されています。
現地を訪れる際に最も注意すべきは、水汲みに関するゾーニングとマナーです。奥の男池湧水池（エメラルドグリーンの池）の周辺は、原生林の植生保護および水質汚染防止のため、立ち入り制限区域が設けられています。池の水を直接ポリタンクで大量に汲み上げる行為や、水中に足を入れる行為は固く禁止されています。
大量の水汲みを行う場合は、男池園地の入口（男池茶屋前）に整備された専用の水汲み場を利用するのが鉄則です。専用パイプから湧水が常時引き込まれており、大型のポリタンクやペットボトルへの給水がスムーズに行えます。地元ボランティアスタッフの証言によると、「休日は朝早くから多くの愛好者が並ぶため、ポリタンクは1人あたり数本程度に留め、後続へ配慮してほしい」とのことです。また、入山管理棟で支払う清掃協力金（1人100円）は、周辺環境の美化やトイレ・木道の修繕に充てられているため、100円硬貨を事前に用意しておくことがスムーズな利用につながります。
