新宿高校の真価を語る上で欠かせないのが、目覚ましい伸長を見せる進学実績の出口戦略です。東京都教育委員会から「進学指導特別推進校」の指定を受ける同校は、東大・京大・一橋大・東京科学大（旧東工大・東京医科歯科大）をはじめとする難関国立大学や、国公立大医学部、さらには早慶上理、GMARCHへの現役合格率向上を至上命題として掲げています。
特筆すべきは、放課後や長期休業中に開講される充実した講座群です。年間の講習コマ数は数百時間に及び、外部予備校に過度に依存せずとも学校のプログラムを軸に大学受験を戦い抜ける仕組みが整えられています。早朝講習や土曜講習、夏期講習はもちろんのこと、共通テスト対策から各大学の2次試験に特化した個別添削指導まで、教員陣が手厚く伴走します。
進路指導室の資料や卒業生へのヒアリング調査によると、新宿高校では「現役志向」が極めて高く、浪人を前提とせず限られた時間の中で最大の学力を引き出す文化が根付いています。自習室の開放時間が長く、新宿の街の喧騒とは隔絶された静謐な環境の中で、夜遅くまで切磋琢磨する生徒たちの姿が日常的な光景となっています。
