旅行者から最も多く寄せられる疑問が「三朝温泉多目的駐車場は完全無料で使えるのか」という点です。現地の運用ルールとして、入庫から最初の1時間は一律無料となっており、それ以降は1時間ごとに100円（普通車）が加算される非常にリーズナブルな設定が採られています。
温泉街の足湯をサッと楽しむ程度や、観光案内所でマップを受け取って周辺を軽く下見するだけなら、実質的に三朝温泉の駐車場を無料で活用できます。半日〜1日かけてじっくり湯治体験やランチを楽しむ場合でも、数時間の駐車で数百円程度に収まるため、周辺のコインパーキングと比較しても極めて財布に優しい設定といえます。
精算時は事前精算機または出庫時のゲート精算を利用します。小銭や千円札を用意しておくと、休日の出庫時もスムーズに手続きを済ませられます。
