生徒や保護者にとって、日々の部活動の選択肢や中学校卒業後の進路実績は極めて重要な関心事です。
部活動の選択肢と地域移行への取り組み
三種町立琴丘中学校の部活動は、生徒数の規模に応じた精鋭化が進んでいます。体育系では野球、バスケットボール、ソフトテニス、陸上競技など、文化系では吹奏楽や総合文化活動などが中心となって活動を展開してきました。少人数ながら地区大会や全県大会で上位入賞を果たす部活動もあり、集中した練習環境が生徒の技術向上を支えています。
現在、全国的な潮流である「部活動の地域移行」や町内他校（八竜中学校・山本中学校）との合同チーム編成も柔軟に導入されており、単独校では成立が難しい競技でも生徒が希望する種目を諦めずに続けられる体制づくりが進められています。
多様な可能性を切り拓く進路実績
卒業後の三種町立琴丘中学校の進路は、生徒一人ひとりの適性と希望に応じた多岐にわたる進学先が特徴です。能代地区の進学校である能代高校や、商業・工業分野に強みを持つ能代松陽高校、さらには秋田市内の進学校（秋田高校、秋田北高校、秋田中央高校など）や秋田工業高等専門学校（秋田高専）への進学実績も見られます。
中学校段階で培われた高い自学自習の習慣と、推薦入試等で強みとなる自己PR力・面接力は、高校受験においても大きな武器となっています。
