CP無制限のPvP「マスターリーグ」において、メタグロスは常に環境の中心（メタゲームの軸）として意識され続けています。
環境に溢れるトゲキッス、フラージェス、ザシアンといった強力なフェアリー勢をタイプ一致のコメットパンチで瞬時に粉砕できるだけでなく、キュレムやマンムーなどのこおりタイプ、さらにはドラゴンタイプの通常技（りゅうのいぶき等）を耐性で受け止めるストッパー役として唯一無二の役割を果たします。
ただし、環境上位のギラティナ（オリジン／アナザー）やネクロズマ、ドリュウズ、ランドロス（れいじゅうフォルム）といったゴースト・じめん技を操るポケモンには明確に不利を取ります。そのため、裏にカイリューやギャラドスなどのひこう・みず複合を控えさせ、弱点の一貫を切るパーティ構築が定石となっています。
