果肉そのものは無毒であっても、その中心にある「種」や外側の「外皮」に致命的な毒素が凝縮されている事例には、細心の注意を払わなければなりません。特にバラ科の果実（桃、すもも、さくらんぼ、びわ、梅、りんご）の種子には、天然の毒性物質である「アミグダリン」をはじめとする青酸配糖体が高濃度に含まれています。
犬が桃やさくらんぼの種を誤飲した時のリスクは、化学的中毒と物理的閉塞の二面性を持っています。愛犬が種を奥歯でガリガリと噛み砕いて飲み込んだ場合、胃酸や消化酵素によってアミグダリンが分解され、猛毒の「シアン化水素（青酸ガス）」が発生します。シアン化合物は細胞内のシトクロムオキシダーゼを阻害して酸素利用を完全に遮断するため、犬は激しい呼吸困難、痙攣、粘膜の鮮赤色化を引き起こし、最悪の場合は数十分から数時間で呼吸停止に至ります。種を噛み砕かずに丸呑みしたとしても安心はできません。表面が硬く尖った桃やスモモの種は、小型犬の狭い幽門や回盲弁（小腸から大腸への移行部）に高確率で引っかかり、激痛を伴う「機械的イレウス（腸閉塞）」を急速に形成します。
一方、犬が柑橘類の皮やスモモを食べた時の影響も見過ごせません。みかんやオレンジ、グレープフルーツの外皮や白皮、スジには「リモネン」と呼ばれる精油成分や「ソラレン」という光毒性物質が含まれています。犬の皮膚や消化管粘膜はリモネンに対して脆弱であり、接触や摂取によって激しい消化器症状や中枢神経抑制、接触性皮膚炎を生じさせます。果汁の酸味による胃酸過多も手伝い、果皮をかじっただけでも激しい下痢や嘔吐を繰り返す引き金になります。
