ハナノキが自生する地域は、植物地理学において「東海丘陵要素（周伊勢湾要素）」と呼ばれる特殊な植物群落エリアに集中しています。具体的には、愛知県北東部・岐阜県東濃地方・長野県南部・滋賀県湖東地域のごく一部に隔離分布しています。
1966（昭和41）年には、その優美さと郷土を象徴する希少性から「愛知県の木」に選定されました。県内では豊田市や新城市などに自生地が保存されており、地域住民による保護育成活動が続けられています。
一方、岐阜県内の自生地も極めて重要な拠点です。中津川市にある「坂本のハナノキ自生地」や恵那市大井町の自生地などは、国の天然記念物に指定されています。これらは大正時代から昭和初期にかけて学術調査が行われ、北米東部に分布するアメリカハナノキ（レッドメイプル）の近縁隔離種として世界的な注目を集めました。
しかし現在、ハナノキが絶滅危惧種に指定されている背景には深刻な環境変化があります。
- 湿地開発と乾燥化：宅地造成や道路建設、圃場整備によって地下水脈が分断され、自生地の湧水が枯渇したこと。
- 植生遷移の進行：湿地が乾燥したことでササ類や他の先駆樹種が侵入し、幼木の生育が阻害されていること。
- 個体群の孤立化：自生地が点在して分断された結果、花粉の交配機会が減少し、遺伝的多様性の低下が懸念されていること。
