事件が起きた現場状況は、一見すると何の変哲もない日常の通学路でした。しかし、捜査本部の検証によって、わずか数百メートルの区間に防犯カメラの死角が連なっており、犯行はこの「空白の数分間」にピンポイントで敢行されたことが判明しています。
発生直後から警察庁および京都府警は延べ数万人規模の捜査員を投入し、徹底的なローラー作戦を展開しました。近隣住民への聞き込み、不審車両の割り出し、さらにはNシステム(自動車ナンバー自動読取装置)の解析が進められましたが、土地勘を持つ加害者によって捜査の撹乱が図られたため、初動捜査は困難を極めました。
家族のもとへ届いた不可解な接触連絡や、現場周辺に残された遺留品のDNA型鑑定が突破口となり、事態は急転直下で被疑者特定へと動きました。しかし、発見に至るまでの空白時間は長く、地域住民に長期にわたる恐怖と不信感を植え付ける結果となりました。