岡山駅から清音駅を利用する旅行者やビジネスパーソンが最も直面しやすいトラブルが、清音駅における井原鉄道井原線への乗り換えとICカード精算の仕組みです。
清音駅はJR西日本のICOCA利用エリア内に位置しており、岡山駅の自動改札機にICカードをタッチして入場し、清音駅の改札機にタッチして出場すること自体には何の問題もありません。しかし、清音駅から井原鉄道に乗り継いで矢掛・井原・神辺方面へ向かう場合、取り扱いが大きく異なります。
井原鉄道の各駅および車内精算システムは、JR西日本のICOCAシステムと完全シームレスに連動していません。そのため、岡山駅からICOCAで入場したまま清音駅で井原鉄道の列車に直接乗り換えてしまうと、降車駅で「JRの入場記録が残ったまま精算できない」という精算トラブルが発生します。
清音駅で井原鉄道へ乗り継ぐ際は、必ず駅構内の中間簡易改札機でICOCAの出場タッチを行うか、あらかじめ岡山駅の券売機で清音経由井原鉄道線の「連絡乗車券（紙のきっぷ）」を購入しておく必要があります。現地の駅員や利用者の間でも「ICカードの処理を忘れて終着駅で証明書発行の手間を取られた」という声が頻繁に見受けられるポイントです。
