北アルプスの山小屋運営において、宿泊人数の適正管理と安全確保を目的とした事前予約制度は完全に定着しています。鏡平山荘を含む双六小屋グループ（双六小屋・鏡平山荘・黒部五郎小舎・わさび平小屋）でも、公式ポータルサイトを起点としたWeb予約システムと電話予約を組み合わせた運用体制が敷かれています。
例年、鏡平山荘の営業期間は7月上旬から10月中旬頃までとなっており、シーズン中の鏡平山荘の予約受付は初夏の指定期日に一斉スタートします。特に夏山最盛期（7月下旬〜8月のお盆期間）や紅葉シーズン（9月下旬〜10月上旬）の週末は、予約開始から短時間で満室となる傾向が続いています。
気になる鏡平山荘の宿泊料金は、1泊2食付きで14,500円〜16,000円前後（素泊まり設定あり・個室利用料別途）が標準的な相場です。食材のヘリコプター空輸コストや水資源管理費が上乗せされる高山地帯のインフラ事情を考慮すれば妥当な設定であり、寝具の清潔感やアメニティ管理の質において利用者から高い信頼を得ています。
