神保町店には整理券制度はなく、完全な先着整列順となっています。そのため、訪問時の混雑予測と現場のルール遵守が極めて重要です。
ピーク時のラーメン二郎神田神保町店の待ち時間は平日でも60分〜90分、土曜日には120分〜150分に達することが珍しくありません。列に加わる際は、店舗前の歩行者通路を塞がないよう指定のカラーコーンや仕切りに沿って整列するラーメン二郎神田神保町店の並び方ルールを徹底してください。近隣はオフィスや商業ビルが立ち並ぶエリアであり、整列マナーの乱れは店舗存続に直結します。
入店が近づくと、店員から「食券を見せてください」または「大きさ（麺の量）を教えてください」と声がかかります。このタイミングで、麺半分や麺少なめを申告します。店側はこの段階でラーメン二郎神田神保町店のロット（1回あたり5〜6杯の調理単位）を緻密に組み立てているため、店内に入ってからの麺量変更はできません。
