WEB予約のプラットフォームも運行会社によって完全に分かれています。スムーズに座席指定を行うためには、検索エンジンに頼る前に適切なポータルサイトへアクセスすることが近道です。
私鉄系（神姫バス・徳島バス・阪神バス・山陽バス）を予約する場合は、高速バス予約 発車オ〜ライネットを利用します。シートマップを見ながら好みの座席を選択でき、事前決済によりQRコード乗車票が即時発行されます。
対するJR系（西日本JRバス・JR四国バス・本四海峡バス）は「高速バスネット」が指定窓口です。こちらではネット決済割引（WEB割）や早期購入割引が適用される便があり、条件が合致すれば私鉄系よりも割安にシートを確保できます。繁忙期や週末の阿波おどりシーズン、連休中は満席が続出するため、乗車日の1ヶ月前の午前10時に予約を入れるのが定石です。
