青山小学校を卒業した児童の進路において、最大の受け皿となるのが隣接地に位置する大津市立青山中学校です。小学校と中学校が近接しており、小中一貫教育の視点を取り入れた連携指導が行われているため、いわゆる「中1ギャップ」による不登校や生活態度の急変が極めて少ない点が大きな強みとされています。
青山中学校は、滋賀県内の公立中学校の中でもトップクラスの学力水準を誇ることで広く知られています。県内屈指の名門公立進学校である滋賀県立膳所高等学校をはじめ、草津東高等学校、石山高等学校などの上位校へ毎年多数の合格者を輩出しています。校内定期テストの難易度が高く、定期テスト対策のために小学校高学年から周辺の大手進学塾（京進、成基学園、馬渕教室など）へ通わせる家庭が一般的な光景となっています。
同時に見逃せないのが、大津市 小学校 中学受験の熱気です。滋賀県全体における私立・国立中学校への進学率は約5〜6％程度ですが、青山小学校においては毎年概ね15％〜20％前後の児童が中学受験に挑戦しています。
主な進学先としては、大津市内にある滋賀大学教育学部附属中学校をはじめ、草津市の立命館守山中学校、近江兄弟社中学校のほか、JR琵琶湖線の利便性を活かして京都・大阪方面の難関私立中（洛南高等学校附属中、高槻中、同志社系列校など）を目指す児童も一定数存在します。教室内に「中学受験をするのが特別なことではない」という空気が自然に醸成されている点は、教育熱心な家庭にとって心強い環境である一方、周囲との学力比較によるプレッシャーを生みやすい側面も内包しています。
