「播但連絡道路に無料区間はあるのか？」という疑問を抱く方が多く見られますが、結論として播但連絡道路の本線自体に無料区間は存在しません。全線が有料区間として運用されています。
ただし、和田山ICで直結している北近畿豊岡自動車道（和田山IC〜豊岡方面）は原則無料で通行できる高規格幹線道路です。このため、「和田山以北は無料、和田山以南の播但道は有料」という境界線を正確に把握しておく必要があります。
また、姫路JCTでの山陽自動車道との乗り継ぎでは、料金所ゲートをスムーズに通過できるものの、NEXCOの通行料金と播但道の通行料金が別々に合算請求されます。短区間の移動であれば、一般道（国道312号など）を一部併用することで高速代を抑える選択肢も検討に値します。
