家庭のリボベジにおいて、開始後1週間以内に脱落してしまう最大の壁が「茎の腐敗」と「根の壊死」です。空芯菜再生栽培の失敗理由を分析すると、初心者が陥りがちな共通のミスが3点浮き彫りになります。
第1の要因は、スーパーで購入した茎の選定ミスです。棚に並んでから日数が経過し、切り口が酸化して黒ずんでいるものや、茎の中空構造が潰れて乾燥している個体は、細胞がすでに死滅しており発根しません。空芯菜水挿し発根のコツは、節（葉が生えていた関節部分）が太く、茎に張りがある新鮮な個体を選ぶことです。発根の原基（根の芽）は必ず節の部分に集中しているため、節の直下1〜2cmで鋭利な刃物を用いて斜め45度に切り直すことが、導管を潰さず吸水させる必須条件です。
第2の要因にして最悪のトラブルが、酸欠による根腐れです。空芯菜水耕栽培の根腐れ対策において最も理解すべきは、「植物の根も呼吸をしている」という点です。ペットボトルの深くまで水を並々と注ぎ、茎を根元まで完全に水没させてしまうと、水中溶存酸素が枯渇し、嫌気性細菌が爆発的に増殖します。水が白く濁り、ドブのような異臭を放ち始めたら根腐れのサインです。水位は常に「発根部が半分浸かり、上半分は空気に触れている状態（水深2〜3cm程度）」を維持しなければなりません。
