物語の核心である「海と空」「誕生祭」「隕石」という3つのエレメントは、生物学と宇宙論が完全に交差するメタファーとして設計されています。
まず、海と空の正体とは何だったのか。彼らはジュゴンに育てられた奇跡の少年として登場しますが、その本質は「星の種（隕石）を受胎地へと運ぶための送達役」です。生物学的な生殖プロセスに擬えるならば、宇宙空間から飛来した隕石は「精子」、地球のあらゆる海流と生命を抱える海洋は「子宮」であり、海と空はその受精を完遂するための遺伝情報伝達物質（受精キャリア）に他なりません。
そして作中で語られる「誕生祭」とは、宇宙の死と再生を司る大規模な創生儀式です。宇宙から降ってきた隕石の記憶を海のミネラル・プランクトン・鯨や魚類の生体エネルギーと融合させ、新たな宇宙のひな形を生み出す神事でした。なぜそこに普通の女子中学生である琉花が必要だったのか。それは、人間という「宇宙を観測する意識」が存在して初めて、誕生した世界が確定するためです。琉花は単なる目撃者ではなく、受精卵に着床の場を与える「触媒としての母体（ゲスト）」だったといえます。
ラストシーンで琉花の手首に残された日焼けの跡は、彼女の腕を海が強く握り締めていた痕跡であり、あの途方もない創生神話が幻想ではなく確かな物理的交感であった証拠として提示されています。彼らが消え去った寂寥感の先に提示されるのは、「肉体を失っても、彼らは今も海水や吐く息、血潮の中に遍在している」という宇宙と海の生命循環の真理です。
