上野エリアという巨大ターミナルに位置するため、時間帯によって店内の混雑度合いは大きく変動します。傾向を把握しておくことで、より快適に買い物を楽しむことができます。
混雑のピークは「土日祝日の14:00〜18:00」です。観光客やファミリー層の利用が重なり、通路やレジ周辺が賑わいます。人混みを避けてじっくり商品を選びたい場合は、平日のオープン直後（11:00〜13:00）または夕方前（15:00〜17:00）が狙い目です。
レジ待ちのストレスを大幅に軽減してくれるのが、導入されているセルフレジシステムです。キャッシュレス決済（クレジットカード、電子マネー、QRコード決済各種、MUJI passport Pay）に完全対応しており、タッチパネルの誘導に沿って素早く精算を完了できます。レジ台数も複数確保されているため、混雑時でも有人レジよりスムーズに進むケースが多く見られます。
