私立中高一貫校を選ぶ家庭にとって、費用面は極めて重要な判断材料です。西大和学園の学費内訳を見ると、入学金、授業料、施設設備費、PTA会費などを合わせた年間学費は標準的な私立進学校と同水準に設定されています。寮生の場合はここに寮費（食費・光熱水費等含む）が加算されますが、予備校代がほぼ不要になるトータルコストを考慮すると、コストパフォーマンスは非常に高いと評価されています。
また、入試成績が極めて優秀な生徒を対象とした特待生制度（学費免除などのスカラシップ）も導入されており、全国トップレベルの頭脳を持つ受験生が挑戦しやすい環境が整備されています。
