愛好家の間で圧倒的な支持を集める改良品種の中には、従来の判別ルールが通用しにくい特殊な体型が存在します。特に選別の現場で混乱を招きやすいのが「ヒカリ体型」と「ヒレ長（ロングフィン・スワロー）系」です。ここでは改良メダカの雌雄判別のコツを整理します。
ヒカリ体型（背中にも光彩が乗り、尾ビレが菱形になる品種）は、解剖学的に背中側へ腹側の構造が反転して現れる変異を持っています。そのため、オスだけでなくメスであっても背ビレが大きく、平行四辺形に近い形状を示します。ヒカリ体型で雌雄を見分ける際は、背ビレ単体での判断を避け、以下のポイントを凝視してください。
- 尻ビレの軟条先端にある「接触微小突起」：成熟したオスの尻ビレ後方軟条には、肉眼やルーペで確認できる極小のトゲ状突起（交尾時にメスを刺激・保持する感覚器）が存在します。
- 腹ビレの長さと産卵管の有無：ヒカリ体型のメスは背ビレ・尻ビレともに大きく発達しますが、産卵期には総排泄孔から乳白色の短い管（産卵管）が明確に突出します。
また、ヒレが優雅に伸長するロングフィン系やモルフォ系では、メスでもヒレ軟条がフサフサと伸びるため、シルエット全体がオス化して見える現象が起きます。この場合、ヒレの輪郭線ではなく「軟条の分岐パターン」や、朝一番の水槽で見られる抱卵状況、あるいは上見での骨格幅（メスは頭骨後方から腹腔にかけての容積が大きい）を基準に据えるのがプロの常套手段です。
