警察の公的な捜査と並行して、地元自治会や有志の市民グループによって「京都男児行方不明事件捜索プロジェクト」が立ち上げられた。地域住民やボランティアの手で捜索チラシの配布や、捜索範囲の聞き込みが自発的に行われている。
民間主導の動きは、広報活動の面でも大きな役割を果たしている。駅前や商業施設でのチラシ配りに加え、地域の防犯ネットワークを活用した情報提供の呼びかけが継続中だ。ただし、二次被害を防ぐため、山地や危険区域への立ち入りについては警察の指示に従うよう呼びかけられており、組織的かつ整然とした協力体制の維持が模索されている。