ビジネスホテルの生命線である客室の居心地についても、細かな配慮が施されています。東横INN京都五条大宮のアメニティと設備は、無駄を削ぎ落としながらも必要な機能が過不足なく揃っています。
客室構成においては、東横INN京都五条大宮の喫煙・禁煙ルームがフロアごとに明確に分煙されています。禁煙ルームの徹底した脱臭・清掃はもちろんのこと、愛煙家のための喫煙ルームも一定数確保されており、双方のニーズに応える設計です。客室内のベッドには快眠をサポートするオリジナルマットレスが採用され、枕元にはスマートフォン充電用のUSBポートと電源コンセントが完備されています。
ロビーフロアには「アメニティバー」が設置されており、スキンケアセット（化粧水や乳液）、歯ブラシ、カミソリ、お茶のティーバッグなどを必要な分だけピックアップするスタイルです。ナイトウェア（ガウン）も専用の殺菌キャビネットから清潔なものを取り出す方式となっており、現代の衛生意識とエコ志向に合致した仕組みが定着しています。
